Come ti ha detto Paolo, nessun problema di utilizzo...
Per spiegarti meglio, però, aggiungo che gli obiettivi motorizzati (AFs) mettono a fuoco utilizzando il proprio motore on board comandato tramite i contatti elettronici sul bocchettone dalla cpu di reflex compatibili. Quindi sulla D90 o altre dsrl con motore AF, le ottiche che possiedi funzionano
esattamente come sulla tua D40. Il motore AF serve per le ottiche compatibili non motorizzate (che sulla D40 puoi utilizzare mettendo a fuoco manualmente) che si collegano meccanicamente al motore AF della reflex tramite un alberino presente sul bocchettone. Questo motore, quindi, resta semplicemente inattivo nel caso di ottiche motorizzate. Altro discorso è invece da fare sulla compatibilità delle vecchie ottiche manual focus, soprattutto pre-Ai, che montate senza le opportune modifiche possono danneggiare la reflex.
Spero di averti chiarito le idee.
Giuseppe